Covid-19是一种攻击上呼吸道和肺部的新型病毒。它的人对人的传播性非常迅速，这在个人生活的各个方面都引起了严重的问题。尽管一些感染的人可能仍然完全无症状，但经常被目睹有轻度至重度症状。除此之外，全球成千上万的死亡案件表明，检测Covid-19是社区的紧急需求。实际上，这是在筛选医学图像（例如计算机断层扫描（CT）和X射线图像）的帮助下进行的。但是，繁琐的临床程序和大量的每日病例对医生构成了巨大挑战。基于深度学习的方法在广泛的医疗任务中表现出了巨大的潜力。结果，我们引入了一种基于变压器的方法，用于使用紧凑卷积变压器（CCT）自动从X射线图像中自动检测COVID-19。我们的广泛实验证明了该方法的疗效，精度为98％，比以前的作品表现优于先前的作品。
translated by 谷歌翻译
基于深度学习的图生成方法具有显着的图形数据建模能力，从而使它们能够解决广泛的现实世界问题。使这些方法能够在生成过程中考虑不同的条件，甚至通过授权它们生成满足所需标准的新图形样本来提高其有效性。本文提出了一种条件深图生成方法，称为SCGG，该方法考虑了特定类型的结构条件。具体而言，我们提出的SCGG模型采用初始子图，并自动重新收获在给定条件子结构之上生成新节点及其相应的边缘。 SCGG的体系结构由图表表示网络和自动回归生成模型组成，该模型是端到端训练的。使用此模型，我们可以解决图形完成，这是恢复缺失的节点及其相关的部分观察图的猖and固有的困难问题。合成数据集和现实世界数据集的实验结果证明了我们方法的优势与最先进的基准相比。
translated by 谷歌翻译
不平衡的数据（ID）是阻止机器学习（ML）模型以实现令人满意的结果的问题。 ID是一种情况，即属于一个类别的样本的数量超过另一个类别的情况，这使此类模型学习过程偏向多数类。近年来，为了解决这个问题，已经提出了几种解决方案，该解决方案选择合成为少数族裔类生成新数据，或者减少平衡数据的多数类的数量。因此，在本文中，我们研究了基于深神经网络（DNN）和卷积神经网络（CNN）的方法的有效性，并与各种众所周知的不平衡数据解决方案混合，这意味着过采样和降采样。为了评估我们的方法，我们使用了龙骨，乳腺癌和Z-Alizadeh Sani数据集。为了获得可靠的结果，我们通过随机洗牌的数据分布进行了100次实验。分类结果表明，混合的合成少数族裔过采样技术（SMOTE） - 正态化-CNN优于在24个不平衡数据集上达到99.08％精度的不同方法。因此，提出的混合模型可以应用于其他实际数据集上的不平衡算法分类问题。
translated by 谷歌翻译
同工型是从同一基因位点产生的MRNA，称为替代剪接。研究表明，超过95％的人类多外XEX基因经历了替代剪接。尽管mRNA序列的变化很少，但它们可能会对细胞功能和调节产生系统的影响。广泛报道了基因的同工型具有不同甚至对比的功能。大多数研究表明，替代剪接在人类健康和疾病中起着重要作用。尽管具有广泛的基因功能研究，但关于同工型功能的信息很少。最近，已经提出了一些基于多个实例学习的计算方法，用于使用基因函数和基因表达谱预测同工型函数。但是，由于缺乏标记的培训数据，他们的性能并不理想。另外，概率模型（例如条件随机场（CRF））已被用于建模同工型之间的关系。该项目使用所有数据和有价值的信息，例如同工型序列，表达曲线和基因本体论图，并提出了基于深神经网络的综合模型。 Uniprot基因本体论（GO）数据库用作基因函数的标准参考。 NCBI REFSEQ数据库用于提取基因和同工型序列，NCBI SRA数据库用于表达式配置文件数据。曲线下（ROC AUC）下的接收器操作特征区域和曲线下的Precision-Recall等指标用于测量预测准确性。
translated by 谷歌翻译
目的：本文侧重于开发鲁棒和准确的加工解决方案，用于连续和较低的血压（BP）监测。在这方面，提出了一种基于深入的基于深度学习的框架，用于计算收缩和舒张BP上的低延迟，连续和无校准的上限和下界。方法：称为BP-Net，所提出的框架是一种新型卷积架构，可提供更长的有效内存，同时实现偶然拨号卷积和残留连接的卓越性能。利用深度学习的实际潜力在提取内在特征（深度特征）并增强长期稳健性，BP-Net使用原始的心电图（ECG）和光电觉体图（PPG）信号而无需提取任何形式的手工制作功能在现有解决方案中很常见。结果：通过利用最近文献中使用的数据集未统一和正确定义的事实，基准数据集由来自PhysoioNet获得的模拟I和MIMIC-III数据库构建。所提出的BP-Net是基于该基准数据集进行评估，展示了有希望的性能并显示出优异的普遍能力。结论：提出的BP-NET架构比规范复发网络更准确，增强了BP估计任务的长期鲁棒性。意义：建议的BP-NET架构解决了现有的BP估计解决方案的关键缺点，即，严重依赖于提取手工制作的特征，例如脉冲到达时间（PAT），以及;缺乏稳健性。最后，构造的BP-Net DataSet提供了一个统一的基础，用于评估和比较基于深度学习的BP估计算法。
translated by 谷歌翻译
确定大脑是否正常发展是儿科神经加理学和神经内科的关键组成部分。婴儿的脑磁共振成像（MRI）展示了超越髓鞘的特定发展模式。虽然放射科医师使用髓鞘模式，脑形态和尺寸特征来确定年龄充足的脑成熟度，但这需要多年的儿科神经皮层经验。没有标准化标准，在三岁之前的MRI中大脑结构成熟度的视觉估计仍然是观察者间和观察者内的差异。大脑发育年龄的更客观估计可以帮助医生们早先识别许多神经发育病症和疾病。然而，这种数据自然是难以获得的，并且观察者地面真理由于评估的主观性而不是黄金标准。在这种光明中，我们探讨了解决这项任务的一般可行性，以及不同方法的效用，包括在T1加权，T2加权的融合中培训的两维卷积神经网络（CNN）和三维卷积神经网络（CNN）质子密度（Pd）来自84个个体受试者的加权序列分为来自出生于3岁的4岁群体。以最佳性能的方法，在中央轴向厚板上使用2D CNN实现0.90 [95％CI：0.86-0.94]的精度。我们讨论了与3D网络的比较，并展示了如何对仅使用一个序列（T1W）的性能。总之，尽管3D CNN方法的理论优势，但在有限数据的情况下，这种方法差不多达到更简单的架构。代码可以在https://github.com/shabanian2018/age_mri-classification中找到
translated by 谷歌翻译
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤，每年负责超过50万人死亡。因此，早期和准确的诊断至关重要。人类专业知识是诊断和正确分类乳腺癌并定义适当的治疗，这取决于评价不同生物标志物如跨膜蛋白受体HER2的表达。该评估需要几个步骤，包括免疫组织化学或原位杂交等特殊技术，以评估HER2状态。通过降低诊断中的步骤和人类偏差的次数的目标，赫洛挑战是组织的，作为第16届欧洲数字病理大会的并行事件，旨在自动化仅基于苏木精和曙红染色的HER2地位的评估侵袭性乳腺癌的组织样本。评估HER2状态的方法是在全球21个团队中提出的，并通过一些提议的方法实现了潜在的观点，以推进最先进的。
translated by 谷歌翻译
疾病预测是医学应用中的知名分类问题。 GCNS提供了一个强大的工具，用于分析患者相对于彼此的特征。这可以通过将问题建模作为图形节点分类任务来实现，其中每个节点是患者。由于这种医学数据集的性质，类别不平衡是疾病预测领域的普遍存在问题，其中类的分布是歪曲的。当数据中存在类别不平衡时，现有的基于图形的分类器倾向于偏向于主要类别并忽略小类中的样本。另一方面，所有患者中罕见阳性病例的正确诊断在医疗保健系统中至关重要。在传统方法中，通过将适当的权重分配给丢失函数中的类别来解决这种不平衡，这仍然依赖于对异常值敏感的权重的相对值，并且在某些情况下偏向于小类（ES）。在本文中，我们提出了一种重加权的对抗性图形卷积网络（RA-GCN），以防止基于图形的分类器强调任何特定类的样本。这是通过将基于图形的神经网络与每个类相关联来完成的，这负责加权类样本并改变分类器的每个样本的重要性。因此，分类器自身调节并确定类之间的边界，更加关注重要样本。分类器和加权网络的参数受到侵犯方法训练。我们在合成和三个公共医疗数据集上显示实验。与最近的方法相比，ra-gcn展示了与最近的方法在所有三个数据集上识别患者状态的方法相比。详细分析作为合成数据集的定量和定性实验提供。
translated by 谷歌翻译